Sunday, November 8, 2009

Oleh: Stephanie Caroline Link

Kelas: XII IPA1/ 31/ SMA Pangudi Luhur Yogyakarta

Email: Kawaiioline@gmail.com

Myblog: www.kawaiioline-sc.blogspot.com


Sintesis Protein

Proses sintesis protein terbagi atas transkripsi dan translasi. Seperti

kita ketahui DNA sebagai media untuk proses transkripsi suatu gen berada di

kromosom dan terikat oleh protein histon. Saat menjelang proses transkripsi

berjalan, biasanya didahului signal dari luar akan kebutuhan suatu protein

atau molekul lain yang dibutuhkan untuk proses pertumbuhan, perkembangan,

metabolisme, dan fungsi lain di tingkat sel maupun jaringan. Kemudian RNA

polymerase II akan mendatangi daerah regulator element dari gen yang akan

ditranskripsi. Kemudian RNA polymerase ini akan menempel (binding) di

daerah promoter spesifik dari gene yang akan disintesis proteinnya, daerah

promoter ini merupakan daerah consesus sequences, pada urutan -10 dan -35

dari titik inisiasi (+1) yang mengandung urutan TATA-Box sebagai basal

promoter. Setelah itu, polimerase ini akan membuka titik inisiasi (kodon ATG)

dari gene tersebut dan mengkopi semua informasi secara utuh baik daerah

exon maupun intron, dalam bentuk molekul immature mRNA (messenger RNA).

Kemudian immature mRNA ini diolah pada proses splicing dengan

menggunakan smallnuclearRNA (snRNA) complex yang akan memotong hanya daerah intron, dan semua exon akan disambungkan menjadi satu urutan gen utuh tanpa non-coding area dan disebut sebagai mature mRNA .

Pada tahap berikutnya, mRNA ini diproses lebih lanjut pada proses

translasi di dalam ribosom, dalam tiga tahapan pokok yaitu inisiasi sebagai

mengawali sintesis polipeptida dari kodon AUG yang ditranslasi sebagai asam

amino methionine. Proses ini berlangsung dengan bantuan initiation factor

(IF-1, IF-2 dan IF3) dan enzim tRNA-methionine synthethase (pada bakteri diawali oleh formylmethionine) sehingga tRNA dan asam amino methionine

membentuk ikatan cognate dan bergerak ke ribosom tempat sintesis protein

berlangsung. Langkah selanjutnya adalah elongasi atau pemanjangan

polpeptida sesuai dengan urutan kodon yang dibawa oleh mRNA.

Gambar5. Proses splicing dari pematangan mRNA.

Pada proses elongasi ini diperlukan elongation factor complex. Seperti

juga proses inisiasi enzim tRNA-amino acid synthethase berperan dalam

pembentukan cognate antara tRNA dan asam amino lainya dari sitoplasma

yang sesuai dengan urutan kodon mRNA tersebut. Proses elongasi akan

berhenti sampai kodon terminasi dan poly-adenyl (poly-A), dan diakhiri

sebagai proses terminasi yang dilakukan oleh rho-protein. Polipeptida akan

diproses sebagai molekul protein yang fungsional setelah melalui proses post-translation di retikulum endoplasmik (RE) hingga tingkat jaringan.


Reproduksi Sel

Kita mengenal tiga jenis reproduski sel, yaitu Amitosis, Mitosis dan Meiosis (pembelahan reduksi). Amitosis adalah reproduksi sel di mana sel membelah diri secara langsung tanpa melalui tahap-tahap pembelahan sel. Pembelahan cara ini banyak dijumpai pada sel-sel yang bersifat prokariotik, misalnya pada bakteri, ganggang biru.

MITOSIS adalah cara reproduksi sel dimana sel membelah melalui tahap-tahap yang teratur, yaitu Profase Metafase-Anafase-Telofase. Antara tahap telofase ke tahap profase berikutnya terdapat masa istirahat sel yang dinarnakan Interfase (tahap ini tidak termasuk tahap pembelahan sel). Pada tahap interfase inti sel melakukan sintesis bahan-bahan inti.

Secara garis besar ciri dari setiap tahap pembelahan pada mitosis adalah sebagai berikut:

1. Profase :
pada tahap ini yang terpenting adalah benang-benang kromatin menebal menjadi kromosom dan kromosom mulai berduplikasi menjadi kromatid.

Membran inti mulai hilang

Nukleolus (anak inti) mulai hilang

Kromosom terlihat tebal dan panjang (terdiri dari 2 kromatid)

Di sitoplasma terdapat sentriol yang membelah menjadi 2 dan bergerak ke arah kutub yang berlawanan, terbentuk benang spindel (mikrotubul)

2. Metafase:
pada tahap ini kromosom/kromatid berjejer teratur dibidang pembelahan (bidang equator) sehingga pada tahap inilah kromosom /kromatid mudah diamati dan dipelajari.

Kromosom mengadakan spiralisasi sehingga menjadi pendek

Ada 3 kegiatan: Proses kongregasi (kromosom bergerak menuju bidang ekuatorial), proses distribusi (kromosom menyebar ke tepi), proses orientasi (kromosom melekatkan diri dengan benang spindel pada sentromer/ kinetokor

3. Anafase:
pada fase ini kromatid akan tertarik oleh benang gelendong menuju
ke kutub-kutub pembelahan sel

Sentromer/ kinetokor membelah menjadi 2

Kromatid ditarik oleh benang spindel ke kutub berlawanan

4. Telofase:
pada tahap ini terjadi peristiwa KARIOKINESIS (pembagian inti menjadi dua bagian) dan SITOKINESIS (pembagian sitoplasma menjadi dua bagian).

Kromatid tunggal sampai di kutub kembali menjadi benang kromatin, membentuk dinding inti kembali

Sitokinesis berlangsung sehingga terjadi dua anak sel yang identik (furrowing).

Meiosis (Pembelahan Reduksi) adalah reproduksi sel melalui tahap-tahap pembelahan seperti pada mitosis, tetapi dalam prosesnya terjadi pengurangan (reduksi) jumlah kromosom.

Meiosis terbagi menjadi due tahap besar yaitu Meiosis I dan Meiosis II Baik meiosis I maupun meiosis II terbagi lagi menjadi tahap-tahap seperti pada mitosis. Secara lengkap pembagian tahap pada pembelahan reduksi adalah sebagai berikut :



Berbeda dengan pembelahan mitosis, pada pembelahan meiosis antara telofase I dengan profase II tidak terdapat fase istirahat (interface). Setelah selesai telofase II dan akan dilanjutkan ke profase I barulah terdapat fase istirahat atau interface.

PERBEDAAN ANTARA MITOSIS DENGAN MEIOSIS

Aspek yang dibedakan

Mitosis

Meiosis

Tujuan

Untuk pertumbuhan

Sifat mempertahan-kan diploid

Hasil pembelahan

2 sel anak

4 sel anak

Sifat sel anak

diploid (2n)

haploid (n)

Tempat terjadinya

sel somatis

sel gonad

Pada hewan dikenal adanya peristiwa meiosis dalam pembentukan gamet, yaitu Oogenesis dan Speatogenesis. Sedangkan pada tumbahan dikenal Makrosporogenesis (Megasporogenesis) dan Mikrosporogenesis.

Mitosis

Mitosis adalah proses pembagian genom yang telah digandakan oleh sel ke dua sel identik yang dihasilkan oleh pembelahan sel. Mitosis umumnya diikuti sitokinesis yang membagi sitoplasma dan membran sel. Proses ini menghasilkan dua sel anakan yang identik, yang memiliki distribusi organel dan komponen sel yang nyaris sama. Mitosis dan sitokenesis merupakan fase mitosis (fase M) pada siklus sel, di mana sel awal terbagi menjadi dua sel anakan yang memiliki genetik yang sama dengan sel awal.

Mitosis terjadi hanya pada sel eukariot. Pada organisme multisel, sel somatik mengalami mitosis, sedangkan sel kelamin (yang akan menjadi sperma pada jantan atau sel telur pada betina) membelah diri melalui proses yang berbeda yang disebut meiosis. Sel prokariot yang tidak memiliki nukleus menjalani pembelahan yang disebut pembelahan biner.

Karena sitokinesis umumnya terjadi setelah mitosis, istilah "mitosis" sering digunakan untuk menyatakan "fase mitosis". Perlu diketahui bahwa banyak sel yang melakukan mitosis dan sitokinesis secara terpisah, membentuk sel tunggal dengan beberapa inti. Hal ini dilakukan misalnya oleh fungi dan slime moulds. Pada hewan, sitokinesis dan mitosis juga dapat terjadi terpisah, misalnya pada tahap tertentu pada perkembangan embrio lalat buah.

Hasil utama dari mitosis adalah pembagian genom sel awal kepada dua sel anakan. Genom terdiri dari sejumlah kromosom, yaitu kompleks DNA yang berpilin rapat yang mengandung informasi genetik vital untuk menjalankan fungsi sel secara benar. Karena tiap sel anakan harus identik secara genetik dengan sel awal, sel awal harus menggandakan tiap kromosom sebelum melakukan mitosis. Proses penggandaan terjadi pada pertengaha intefase, yaitu fase sebelum fase mitosis pada siklus sel.

Setelah penggandaan, tiap kromosom memiliki kopi identik yang disebut sister chromatid, yang berlekatan pada daerah kromosom yang disebut sentromer. Sister chromatid itu sendiri tidak dianggap sebagai kromosom.

Meiosis

Meiosis adalah salah satu cara sel untuk mengalami pembelahan. Ciri pembelahan secara meiosis adalah:

  • Terjadi di sel kelamin
  • Jumlah sel anaknya 4
  • Jumlah kromosen 1/2 induknya
  • Pembelahan terjadi 2 kali

Meiosis hanya terjadi pada fase reproduksi seksual atau pada jaringan nuftah. Pada meiosis, terjadi perpasangan dari kromosom homolog serta terjadi pengurangan jumlah kromosom induk terhadap sel anak. Disamping itu, pada meiosis terjadi dua kali periode pembelahan sel, yaitu pembelahan I (meiosis I) dan pembelahan II (meiosis II)

Sunday, September 27, 2009

BioLogi

ENZIM

Metabolisme merupakan keseluruhan reaksi kimia dalam sel yang melibatkan enzim yang berfungsi sebagai biokatalosator. Biokatalisator adalah zat dapat mempercepat reaksi yang terjadi di dalam sel makhluk hidup. Enzim yang berfungsi sebagai biokatalisator tersusun atas senyawa protein dan nonprotein.

Komponen Enzim
Komponen enzim secara kimiawi enzim tersusun atas dua bagian, yaitu bagian protein (apoenzim) dan bagian bukan protein (gugus prostetik).
  • Apoenzim
Apoenzim merupakan baguan enzim aktif yang tersusun atas protein dan mudah berubah (labil) terhadap factor lingkungan, misalnya pH dan suhu.
  • Gugus Prostetik
Gugus prostetik merupakan gugus yang tidak aktif, berupa unsur-unsur logam, seperti besi (Fe2+), mangan (Mn2+), magnesium (Mg2+) atau natrium (Na+) yang disebut kofaktor. Gugus prostetik juga dapat berupa bahan organik bukan protein, seperti vitamin B yang disebut Koenzim.

Kerja Enzim
Kerja EnzimSecara sederhana cara kerja enzim dapat digambarkan melalui hipotesis kunci dan gembok (lock and key hypothesis). Kompleks enzim substrat terbentuk, karena pada permukaan enzim terdapat suatu tempat yang disebut sisi aktif (active site). Sisi aktif enzim mempunyai konfigurasi aktif tertentu dan hanya substrat tertentu dapat bergabung. Hal itu, menyebabkan enzim bekerja secara spesifik.
Contoh flashnya hipotesis kunci dan gembok (lock and key hypothesis) adalah seperti ini..














Sifat-Sifat Enzim

  • Biokatalisator
Enzim berfungsi mempercepat reaksi kimia atau sebagai penyebab dimulainya suatu proses reaksi kimia dalam sel. Proses percepatan reaksi kimia oleh enzim dengan cara menurunkan energi aktivasinya. Kemampuan enzim untuk memulai reaksi ikut bereaksi dan terbentuk kembali, pada akhir reaksi kimia itulah yang dapat mendorong berkurangnya penggunaan energi aktivasi pada awal reaksi kimia.





  • Protein
Enzim adalah suatu protein sehingga sifat-sifat enzim sama dengan protein, yaitu dipengaruhi oleh suhu dan pH. Suhu akan berpengaruh pada bagian apoenzim (protein aktif), di mana suhu rendah protein enzim akan mengalami koagulasi dan pada suhu yang tinggi akan menyebabkan denaturasi. potensial Hidrogen (pH) mempengaruhi enzim pada bagian protein terutama pada gugus karboksilat dan gugus amin pada asama amino penyusun proteinnya.
  • Bekerja Spesifik
Dalam suatu reaksi pengobatan atau mereaksikan suatu zat tertentu diperlukan enzim tertentu atau one enzyme one substrate (satu jenis enzim hanya untuk satu substrat). Contoh enzim maltase hanya dapat memecah maltosa menjadi glukosa saja.
  • Tidak Berperan Bolak Balik
Enzim dapat bekerja menguraikan suatu substrat menjadi substrat tertentu dan tidak sebaliknya dapat menyusun substrat semula dari hasil penguraian. Sebagai contoh, enzim kelompok protease dapat menguraikan protein menjadi asam amino, tetapi tidak dapat menggabungkan asam amino-asam amino menjadi protein.
  • Bekerja Cepat
Sifat kerja ini disebabkan karena enzim hanya berfungsi untuk menurunkan energi aktivasi pada awal reaksi kimia dalam sel.
  • Bersifat Bolak-Balik (Enzim ikut bereaksi dan akan terbentuk kembali di akhir reaksi)
Pada saat ikut bereaksi struktur kimia enzim berubah dan struktur kimia enzim akan terbentuk kembali seperti semula pada akhir reaksi.
  • Kerja enzim dipengaruhi lingkungan
Lingkungan yang dimaksud adalah suhu, pH, dan zat penghambat (inhibitor)

Penamaan enzim
Tata cara penamaan enzim umunya disesuaikan nama substrat yang dipecah atau tipe reaksi kimia yang dipercepat (dikatalis) oleh enzim dan diberi akhiran -ase. Misalnya, karbonase yaitu enzim untuk memecah karbohidrat, protease untuk enzim yang memecah protein, lipase untuk enzim yang memecah lemak.
(tabel)
Jenis-jenis tersebut hanya merupakan contoh enzim yang ada. Masih banyak jenis enzim lain dengan peran yang lain pula. Contoh lain enzim yang berperan dalam metabolisme adalah enzim katalase. Enzim ini terdapat pada semua jaringan tubuh, terutama terkonsentrasi tinggi dalam hati, jantung, ginjal, dan darah. Selama pernapasan, terbentuk hidrogen peroksida yang bersifat racun dan dapat menyebabkan kerusakan sel. Namun, oleh enzim katalase, hidrogen peroksida dapat diuraukan menjadi air dan oksingen.

Setelah membaca isi blog di atas, silahkan anda coba latian soal di bawah ini untuk mengetahui seberapa banyak kemampuan anda memahami tentang enzim..








Dan jika anda merasa anda sudah cukup memahami enzim, silahkan mencoba tes di bawah ini..